9号线一期工程全线站点分别为：新桥、高滩岩、天梨路、沙坪坝、小龙坎、土湾、红岩村、富华路、化龙桥、李家坪、蚂蝗梁、观音桥、鲤鱼池、刘家台、江北城、五里店、溉澜溪、头塘、保税港、邮轮母港、何家梁、石盘河、上湾路、青岗坪、宝圣湖、兴科大道站。（新桥、邮轮母港未开通）

　　9号线二期站点有：兴科大道站、春华大道站、兰桂大道站、中央公园东站（10号线号线换乘）、花石沟站。

　　二期消息重庆轨道交通9号线二期工程全部位于渝北区空港新城和两江新区范围内，起于兴科大道站，线路向北经春华大道、兰桂大道、中央公园东、从岩寺至终点花石沟站。2022年8月23日，地铁9号线二期工程（兴科大道~花石沟）顺利通过项目工程验收，并于当天开始不载客试运行。